โรงเรียนกีฬาจังหวัดสุพรรณบุรี เป็นโรงเรียนกีฬาสมบูรณ์แบบแห่งแรกที่ตั้งขึ้นในประเทศไทย เพื่อต้องการยกระดับและพัฒนามาตรฐานทางการกีฬาให้ทัดเทียมกับนานาอารยประเทศประกอบกับเพื่อสนองนโยบายรัฐบาล ในการส่งเสริมการกีฬาอย่างกว้างขวางและทั่วถึงเพื่อเสริมสร้างคุณภาพชีวิตและพัฒนามาตรฐานทางการศึกษาเพื่อให้มีขีดความสามารถในการเข้าร่วมการแข่งขันกีฬากับนานาชาติ ได้ดียิ่งขึ้น และมติคณะรัฐมนตรีให้ประเทศไทยรับเป็นเจ้าภาพจัดการแข่งขันกีฬาซีเกมส์ ครั้งที่ 13 ในปี พ.ศ. 2541 และกีฬาโอลิมปิกในปี 2547 ในการประชุมคณะรัฐมนตรีเมื่อวันที่ 30 พฤษภาคม 2532 ในการดำเนินงานกรมพลศึกษาได้แต่งตั้งคณะทำงานเพื่อศึกษาสภาพปัญหาในการพัฒนาพลศึกษา และกีฬาของชาติ ตั้งแต่อดีตจนถึงปัจจุบัน และศึกษาแนวทางดำเนินงานส่งเสริมและพัฒนามาตรฐานทางการกีฬา ของต่างประเทศ แล้วจัดทำเป็นโครงการที่เป็นรูปธรรมและมีแนวทางปฏิบัติอย่างชัดเจนโดยผสมผสานการดำเนินงานทุกระบบเข้าด้วยกัน ทั้งทางด้านการศึกษา เศรษฐกิจ สังคมการเมืองและวิทยาศาสตร์การกีฬาา
การดำเนินงานการจัดตั้ง กรมพลศึกษาโดยอธิบดีกรมพลศึกษานายปรีดา รอดโพธิ์ทอง และ รองอธิบดีกรมพลศึกษา นายสุวิทย์ วิสุทธิสิน ได้เสนอโครงการจัดตั้งโรงเรียนกีฬาต่อ ฯพณฯ บรรหาร ศิลปอาชา สมาชิกสภา ผู้แทนราษฎรจังหวัดสุพรรณบุรี ในขณะนั้นพิจารณาให้การสนับสนุนและได้เสนอให้ก่อตั้งในวิทยาลัยพลศึกษาจังหวัดสุพรรณบุรี ทางทิศตะวันตกของพื้นที่ และได้มีการหารือกันหลายครั้ง จนประสบความสำเร็จ โดยตกลงที่จะจัดตั้งโรงเรียนกีฬาในวิทยาลัยพลศึกษาจังหวัดสุพรรณบุรีและได้มีการวางแผน การจัดตั้งโรงเรียนโดยใช้งบประมาณการก่อสร้างตลอดจนบุคลากรจากกรมพลศึกษาโดยแต่งตั้งให้นายสมบัติ คุรุพันธ์ หัวหน้าฝ่ายวิทยาลัยพลศึกษา ปฏิบัติหน้าที่ในฐานะผู้อำนวยการ โครงการจัดตั้งโรงเรียนกีฬาจังหวัดสุพรรณบุรี ปี พ.ศ. 2534 และได้รับแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ คนแรกใน ปี พ.ศ. 2536 กระทรวงศึกษาธิการได้ประกาศจัดตั้งโรงเรียนกีฬาจังหวัดสุพรรณบุรี เมื่อวันที่ 7 สิงหาคม 2533 โดยได้รับงบประมาณต่อเนื่องตลอดมาทั้งปี งบประมาณ 2534 ซึ่งได้รับความช่วยเหลือ และสนับสนุน ดำเนินงานจาก ฯพณฯ บรรหาร ศิลปอาชา (นายกรัฐมนตรีคนที่ 21) อย่างดียิ่งตลอดมา ได้เข้าตรวจเยี่ยม ดูแลกิจการการดำเนินงานและความเป็นอยู่ของนักเรียน ครู อาจารย์ และบุคลากรเป็นประจำ นอกเหนือ จากการให้ความช่วยเหลือ และสนับสนุนด้านงบประมาณการก่อสร้างอาคารสถานที่ ตามลำดับดังนี้
1. อาคารเรียน 3 ชั้น จำนวน 1 หลัง
2. อาคารศูนย์วิทยาศาสตร์การกีฬา จำนวน 1 หลัง
3. โรงอาหาร จำนวน 1 หลัง
4. หอพักนักเรียน 3 ชั้น และ 5 ชั้น จำนวน 6 หลัง
5. สระว่ายน้ำพร้อมสระกระโดด จำนวน 1 หลัง
6. อาคารฝึกกีฬารวม (ยิมส์แฝด) จำนวน 1 หลัง